До 1 января 2006 года отчетные периоды по транспортному налогу Налоговым кодексом РФ предусмотрены не были.
Тем не менее во многих регионах на налогоплательщиков возлагались обязанности по уплате авансовых платежей и представлению расчетов по авансовым платежам по транспортному налогу. Кроме того, во многих случаях с налогоплательщиков взыскивались пени за просрочку уплаты авансовых платежей по транспортному налогу.
После того как в Постановлении Президиума ВС РФ от 11.05.2005 № 32пв04 было указано на неправомерность уплаты авансовых платежей по транспортному налогу, Минфин РФ решил, что в случае признания закона субъекта РФ о транспортном налоге противоречащим федеральному законодательству и, следовательно, недействующим налогоплательщики в силу ст. 21 НК РФ имеют право на возврат сумм излишне уплаченных или излишне взысканных налогов, пеней, штрафов.
Об этом и было сообщено в Письме от 13.02.2006 № 03-06-04-02/02.
Письмом от 02.06.2006 № 03-06-02-02/73 Минфин еще раз подтвердил свою позицию по данному вопросу, сообщив, что в настоящее время определениями ВС РФ от 01.02.2006 № 59-Г05-26 и от 29.03.2006 № 33-Г06-4 признаны не действующими в части установления авансовых платежей по транспортному налогу соответственно положения Закона Амурской области от 18.11.2002 № 142-ОЗ и Закона Ленинградской области от 22.11.2002 № 51-ОЗ.