На основании Определения ВАС РФ от 28.05.2008 № 6214/08 и Решения ВАС РФ от 24.01.2008 № 16720/07 Минфин изменил свою точку зрения по вопросу возможности применения УСН организациями, созданными с участием РФ, субъектов РФ или муниципальных образований, доля участия которых превышает 25% (Письмо Минфина России от 07.08.2008 № 03-11-02/89).
Положения Налогового кодекса накладывают определенные ограничения на возможность применения организациями упрощенной системы налогообложения. В частности, подп. 14 п. 3 ст. 346.12 НК РФ предусмотрено, что УСН не вправе применять организации, в которых доля участия других организаций составляет более 25 %.
Минфин в своих письмах от 12.03.2007 № 03-11-02/66 и от 08.05.2007 № 03-11-02/124, направленных Письмом ФНС от 21.05.2007 № ММ-6-02/406@ в нижестоящие налоговые органы, пришел к выводу, что данное ограничение распространяется и на участие в организации Российской Федерации, субъектов Российской Федерации и муниципальных образований. Минфин исходил из того, что РФ, субъекты РФ и муниципальные образования подпадают под понятие «организации» в целях применения подп. 14 п. 3 ст. 346.12 НК РФ.
Однако ВАС РФ признал данный вывод не соответствующим действующему налоговому законодательству. Логика рассуждений судей была следующая.
Согласно ст. 11 НК РФ организациями признаются юридические лица, образованные в соответствии с законодательством РФ, а также иностранные юридические лица, компании и другие корпоративные образования, обладающие гражданской правоспособностью, созданные в соответствии с законодательством иностранных государств, международные организации, филиалы и представительства указанных иностранных лиц и международных организаций, созданные на территории РФ.
РФ, субъекты РФ и муниципальные образования не подпадают под указанное в ст. 11 НК РФ определение организации и не являются юридическими лицами по смыслу гражданского законодательства. Поэтому судьи посчитали, что участие указанных субъектов в акционерных обществах не является основанием, препятствующим применению такими акционерными обществами УСН.
Иными словами, доля участия РФ, субъектов РФ или муниципальных образований в организации, применяющей УСН, может превышать 25%.
Минфин в Письме от 07.08.2008 № 03-11-02/89 указал, что при рассмотрении заявлений налогоплательщиков о переходе на применение упрощенной системы налогообложения следует руководствоваться вышеназванными Определением и Решением ВАС РФ.