Организации, работающие на УСН, при определении объекта налогообложения учитывают следующие доходы (ст. 346.15 НК РФ):
• от реализации товаров (работ, услуг), имущества и имущественных прав, определяемые в соответствии со ст. 249 НК РФ;
• внереализационные, определяемые в соответствии сост. 250 НК РФ.
Суммы кредиторской задолженности, списанные в связи с истечением срока исковой давности, за исключением случаев, предусмотренных подп. 22 п.1 ст. 251 НК РФ, в целях налогообложения признаются внереализационными доходами (п. 18 ст. 250 НК РФ). Следовательно, ваша организация должна включить ее в доходы.
Действительно, как быть с НДС, учтенным в сумме кредиторской задолженности? К сожалению, в вопросе вами не указан объект налогообложения по единому налогу. Допустим, что ваша организация уплачивает единый налог с разницы между доходами и расходами. В данном случае сумму НДС отнести в расходы вы не сможете, несмотря на то, что согласно подп. 8 п.1 ст. 346.16 НК РФ суммы НДС по приобретаемым товарам (работам, услугам) учитываются при определении объекта налогообложения по единому налогу.
У организаций, применяющих УСН, затраты признаются после их фактической оплаты (п. 2 ст. 346.17 НК РФ). То есть затраты признаются расходами при выполнении одновременно двух условий: они должны быть осуществлены и оплачены. Как мы видим, одно из условий было не выполнено. Поскольку НДС, предъявленный поставщиком, вашей организацией уплачен не был, суммы НДС нельзя включить в расходы при исчислении единого налога.