Компания является налоговым агентом по НДС, если она:
-
купила на территории РФ товары (работы, услуги) у иностранной организации, не состоящей на учете в российских налоговых органах (п. 2 ст. 161 НК РФ);
-
приобрела государственное или муниципальное имущество или арендовала его (п. 3 ст. 161 НК РФ);
-
продает конфискованное имущество, бесхозные ценности или имущество, реализуемое по решению суда (п. 4 ст. 161 НК РФ).
В вышеперечисленных ситуациях компания — налоговый агент должна исчислить и заплатить в бюджет соответствующую сумму НДС, а затем принять уплаченную сумму налога к вычету (п. 3 ст. 171, п. 4 ст. 173 НК РФ). Пунктом 1.1 ст. 172 НК РФ установлен трехлетний срок для вычета НДС. Но он касается только вычетов, предусмотренных п. 2 ст. 171 НК РФ. К ним относятся суммы НДС, предъявленные налогоплательщику при приобретении товаров (работ, услуг) либо уплаченные при ввозе товаров на территорию РФ (письма Минфина России от 06.08.2015 № 03-07-11/45515, от 12.05.2015 № 03-07-11/27161).
Для иных вычетов НДС (например, исчисленного с сумм оплаты, предварительной оплаты; предъявленного продавцом товаров (работ, услуг) в отношении сумм оплаты, частичной оплаты; уплаченного в качестве налогового агента и др.) налогоплательщики не вправе применять положения п. 1.1 ст. 172 НК РФ. В связи с этим такие вычеты следует осуществлять в том налоговом периоде, в котором у налогоплательщика выполнены соответствующие условия, предусмотренные ст. 171 и 172 НК РФ. То есть когда товары (работы, услуги) приняты к учету и их предполагается использовать в операциях, облагаемых НДС, имеются соответствующие первичные документы и счет-фактура. К такому выводу пришел Минфин России в письмах от 17.11.2016 № 03-07-08/67622, от 09.04.2015 № 03-07-11/20290.
Итак, положения п. 1.1 ст. 172 НК РФ на вычеты НДС налоговыми агентами не распространяются. Но это не значит, что налоговый агент теряет возможность вычета НДС, если он не заявил его в налоговом периоде, когда у него возникло право на него.
В своих письмах Минфин России неоднократно разъяснял, что в случае осуществления организацией вычета НДС в более поздние сроки, чем возникло право на вычет, нужно подать уточненную декларацию за налоговый период, в котором появилось право на применение налогового вычета. При этом на основании положений п. 2 ст. 173 НК РФ представить ее можно в течение трех лет после окончания налогового периода, в котором возникло указанное право (письма от 12.03.2013 № 03-07-10/7374, от 13.02.2013 № 03-07-11/3784, от 15.01.2013 № 03-07-14/02). Аналогичного мнения придерживаются ФНС России (письмо от 30.03.2012 № ЕД-3-3/1057@) и арбитры (постановление ФАС Волго-Вятского округа от 31.01.2011 по делу № А11-2497/2010 (Определением ВАС РФ от 17.05.2011 № ВАС-5739/11 отказано в передаче дела на пересмотр)).