Согласно п. 10 ст. 217 НК РФ не облагаются НДФЛ суммы, уплаченные работодателями за оказание медицинских услуг своим работникам, их супругам, родителям, детям (в том числе усыновленным), подопечным в возрасте до 18 лет, а также бывшим своим работникам, уволившимся в связи с выходом на пенсию по инвалидности или по старости, и оставшиеся в распоряжении работодателей после уплаты налога на прибыль организаций.
Указанные доходы освобождаются от налогообложения в случае безналичной оплаты работодателями медицинским организациям расходов на оказание медицинских услуг налогоплательщикам, а также в случае выдачи наличных денежных средств, предназначенных на эти цели, непосредственно налогоплательщику (членам его семьи, родителям, законным представителям) или зачисления средств, предназначенных на эти цели, на счета налогоплательщиков в банках.
То есть не имеет значения, прямая ли это оплата медицинских услуг работодателем или компенсация расходов физического лица.
В силу п. 2 ст. 346.11 НК РФ применение организациями УСН предусматривает их освобождение от обязанности по уплате налога на прибыль организаций.
Поскольку организация на УСН не является плательщиком налога на прибыль, по мнению финансистов, норма п. 10 ст. 217 НК РФ об освобождении от обложения НДФЛ сумм, уплаченных работодателями за оказание медицинских услуг их работникам, упрощенцами не применяется (см. письма Минфина России от 11.12.2020 № 03‑01‑10/108791, от 10.12.2020 № 03‑04‑06/108150, от 16.03.2020 № 03‑04‑06/19819).
То есть имеется высокий риск, что у организации на УСН не примут освобождение от НДФЛ оплаты расходов физического лица на медицинское обследование. Но можно попробовать оспорить этот отказ в суде.
Смотрите материал: «Оплата организацией на УСН оказанных физлицу медицинских услуг» (М.Д. Самойлова, журнал «Оплата труда: бухгалтерский учет и налогообложение», № 6, июнь 2023 г.).
Что касается страховых взносов, то, по мнению чиновников, поскольку оплата стоимости лечения работников не поименована в перечне ст. 422 НК РФ, следовательно, подлежит обложению страховыми взносами (см. письма Минфина России от 25.01.2022 № 03‑04‑06/4455, от 24.01.2018 № 03‑04‑06/3828).
Такой подход тоже можно оспаривать только в судебном порядке (см. Определение Верховного суда РФ от 29.11.2016 307-КГ16-15884 по делу № А21-2218/2015 об обложении страховыми взносами компенсации расходов на оплату стоматологических услуг).
Имеет значение, по мнению судей, что данные выплаты не являются стимулирующими, не зависят от квалификации работников, сложности, качества, количества, условий выполнения самой работы, не являются оплатой труда работников (вознаграждением за труд), не предусмотрены трудовыми договорами.