Такая позиция сформулирована в Письме Минфина России от 20.05.2010 № 03-07-11/189.
В Письме указано, что на основании подп. 2 п. 1 ст. 162 Налогового кодекса налогообложению НДС подлежат полученные налогоплательщиком денежные средства, связанные с оплатой реализованных этим налогоплательщиком товаров (работ, услуг). По мнению Минфина России, суммы денежных средств, полученные налогоплательщиком от покупателей товаров (работ, услуг) в виде пеней за несвоевременную оплату реализованного товара, следует относить к суммам, связанным с оплатой этих товаров (работ, услуг). Поэтому указанные суммы подлежат включению в налоговую базу по НДС. При этом на основании п. 4 ст. 164 Кодекса при получении указанных денежных средств сумма налога исчисляется расчётным методом исходя из налоговой ставки, которая определяется как процентное отношение налоговой ставки в размере 18% к налоговой базе, принятой за 100 и увеличенной на соответствующий размер налоговой ставки (18/118).