Если работник организации работает по совместительству в филиале этой же организации, НДФЛ с доходов работника, выплачиваемых за работу по совместительству, уплачивается по месту нахождения филиала.
Суммы НДФЛ с доходов надомника уплачиваются по месту учёта организации, осуществляющей выплаты по трудовому договору такому работнику. На указанный порядок перечисления НДФЛ не влияет место проживания надомника, а также то обстоятельство, что в данном месте организация поставлена на учёт по месту нахождения филиала (Письмо Минфина РФ от 14.04.2011 № 03-04-06/3-89).