Минфин России в письме от 19.09.2013 № 03-04-06/38889 напомнил, что НДФЛ с доходов работников обособленных подразделений должен быть перечислен в бюджет по месту постановки на учет организации по месту нахождения соответствующего обособленного подразделения.
При этом если сотрудник в течение месяца работает в нескольких обособленных подразделениях (строительных участках), то НДФЛ с его доходов подлежит уплате в соответствующие бюджеты по месту нахождения каждого такого обособленного подразделения с учетом отработанного времени.