Федеральным законом от 23.07.2013 № 248-ФЗ п. 8 ст. 101 НК РФ был дополнен новым положением, обязывающим в решении, выносимом по результатам проведенной налоговой проверки, отражать сумму налога, излишне возмещенную на основании решения налогового органа. Она показывается в качестве недоимки по налогу со дня фактического получения налогоплательщиком средств (в случае возврата суммы налога) или со дня принятия решения о зачете суммы налога, заявленной к возмещению (в случае зачета суммы налога).
В письме от 20.09.2013 № АС-4-2/16981 специалисты ФНС России обратили внимание, что такие суммы подлежат отражению в решениях, принимаемых налоговыми органами с 24 августа 2013 г., вне зависимости от периода, когда была начата налоговая проверка. Кроме того, фискалы отметили, что такой недоимкой могут быть признаны суммы любого налога, излишне возмещенного налоговым органом.