Минфин России разъяснил, что средства, предоставленные унитарному предприятию (коммерческой организации) из федерального бюджета в рамках государственных контрактов на модернизацию амортизируемого имущества, закрепленного за ним на праве хозяйственного ведения, не относятся к средствам целевого финансирования. Поэтому расходы, произведенные за счет таких средств, увеличивают первоначальную стоимость указанного имущества. И амортизация по нему начисляется в общеустановленном порядке.
Суммы НДС, предъявленные подрядчиками по выполненным работам, оплачиваемым за счет средств федерального бюджета, к вычету не принимаются.
(Письмо Минфина России от 23.12.2013 № 03-03-06/4/56546)