Согласно п. 3 ст. 226 НК РФ налоговые агенты исчисляют НДФЛ по итогам каждого месяца. Расчет ведется нарастающим итогом с начала года. При этом в каждом месяце к доходам налогоплательщиков, облагаемым по ставке 13%, применяются положенные им стандартные налоговые вычеты (ст. 218 НК РФ).
Если в отдельные месяцы у налогоплательщика не было дохода, облагаемого НДФЛ по ставке 13%, стандартные вычеты предоставляются в последующих месяцах, в которых доход получен, в том числе и за те месяцы, когда доходов не было.
Если же выплата дохода с какого-то месяца полностью прекращена, налоговая база за следующие месяцы не определяется, поэтому стандартные вычеты за месяцы, когда не было дохода, не предоставляются.
Такие разъяснения содержатся в письме Минфина России от 22.10.2014 № 03-04-06/53186.