Если величина собственного капитала организации-заемщика отрицательна, то она не может учесть при расчете налога на прибыль проценты по контролируемой задолженности.
К такому выводу пришли специалисты Минфина России в письме от 10.08.2016 № 03-03-06/1/46720. Аргументация следующая.
Согласно с п. 4 ст. 269 НК РФ положительная разница между начисленными процентами и предельными процентами, исчисленными в соответствии с п. 2 ст. 269 НК РФ, приравнивается в целях налогообложения к дивидендам, уплаченным иностранной организации, в отношении которой существует контролируемая задолженность. Такая разница облагается налогом в соответствии с п. 3 ст. 284 НК РФ.
В случае если на конец отчетного (налогового) периода величина собственного капитала организации отрицательна, то проценты по займу не учитываются в составе расходов при расчете налога на прибыль (предельные проценты равны нулю). Начисленные проценты в полном объеме приравниваются к дивидендам и не учитываются российской организацией - заемщиком в составе расходов.